Organizon dhe drejton punën dhe veprimtarinë e IKShPK-së, duke përfshirë organizimin e punës profesionale si dhe sigurimin e shërbimeve cilësore, të sigurta, efikase dhe efektive; Mbështet dhe ofron këshilla për Ministrin e Shëndetësisë në përcaktimin e politikave dhe strategjive;
Siguron zhvillimin dhe zbatimin e strategjive, duke përfshirë planifikimin e programeve dhe iniciativave që përshtaten me nevojat shëndetit publik;
Siguron zbatimin e legjislacionit, politikave dhe të vendimeve të ministrit;
Siguron bashkëpunimin dhe koordinimin me ministrinë dhe institucionet tjera si dhe prezanton dhe përfaqëson IKShPK-në;
Menaxhon me burimet financiare, materiale dhe njerëzore, të IKShPK-së, në përputhje me legjislacionin në fuqi;
Propozon planin dhe raportin vjetor të performancës së IKShPK-së si dhe monitoron, vlerëson performancën e institutit për të siguruar që shërbimet dhe programet janë efektive dhe përgjigjen nevojave të shëndetit publik;
Realizon çdo përgjegjësi tjetër, që i caktohet me ligj, statut apo i delegohet shprehimisht nga ministri.